文部科学省の調査によると、２０１８年度に小学校、中学校で不登校だった児童の人数は過去最高の１６万４５２８人（１００人当たり１・６９人）でした。調査が開始された９１年度は、約６万７千人（同０・４７人）。
０１年度の１３万９千人（同１・２３人）をピークに以後、微減傾向でしたが、１３年度から増加に転じ、直近３年（１６～１８年度）は、過去最高を更新し続けています。

文科省は１９年秋、全小中学校に向けて、不登校に対する新しい「支援の在り方」を通知しました。
フリースクールやＩＣＴ教育（情報技術を活用した教育手法）を利用する子どもの増加を反映し、「必ずしも学校復帰を求めない」こととしています。